古い情報なので削除
クリップボード履歴をOFFにしてください。具体的には「その他→動作環境→編集」タブの「クリップボードの履歴を取る」のチェックを外します。
[補足]
これはWord97のバグのようです。秀丸エディタのクリップボード履歴に限らず、 同様の機能を持つ複数のソフトウェアで再現性が確認されています。 Word97でメニュー表示される「切り取り」を選択すると再現します。 いまのところクリップボード履歴を使わないようにするとか、 Word97を立ち上げる前にクリップボード履歴をOFFにするなどの消極的な対策しかないようです。 なお、Word97以外のMS-Office97の製品では再現しないようです。