現時点(秀丸エディタ ver.8.50)では、検索/置換の「選択した範囲内のみ」の機能は秀丸エディタ内部の構造上、 論理行(改行までを1行と数える)単位になっています。
例えば、選択範囲の始まりが行頭でない場合、検索/置換の開始場所は選択範囲の始まりの場所の行の行頭になります。 また同様に、検索/置換の終わりは選択範囲の終わりの行の行末になります。 また、「選択した範囲内のみ」チェックボックスが選択できるのは、複数行を選択している場合だけです。
単一の行の中を選択した場合は、選択した文字列が検索/置換ダイアログの検索文字列に取り込まれます。 (※文字列が長いと取り込まれません)